合肥综合保税区是经国务院批准的安徽省首个综合保税区，位于合肥新站综合开发试验区，围网内规划用地面积2.6平方公里。在初步规划中，对合肥综保区目标、功能、产业发展定位和总体布局形成了较为具体的方案。初步方案明确，将围绕打造中西部地区重要的国际运输中转枢纽和加工贸易基地、内陆“大通关、大开放”的示范区、我省深化对外开放的先行先导区和重要标志的目标定位，立足合肥经济圈、服务中西部、面向亚太，打造以保税加工为主，保税物流为辅，积极拓展口岸物流和保税服务等功能于一体、配套服务完善的综合保税区。产业定位为以新型平板显示、新能源等战略性新兴产业为特色的加工业基地；以进出口贸易为主的国际贸易基地和现代物流基地。并鼓励发展研发设计、采购配送、贸易结算、展示交易、检测维修等业务，完善和拓展相关功能。
为确保政策功能的有效发挥、区内业务的高效运作，合肥综保区将实行“一线放开、二线管住、区内自由”监管方式，设立统一海关卡口，实行封闭式、信息化、集约型管理。目前，综保区区内主干路网建设已全面铺开，按照海关特殊监管区域基础和监管设施验收标准，各项基础设施建设加快推进。
