南沙在航运业方面与香港相比，并不具备绝对优势。国家发改委副秘书长范恒山曾指出“南沙新区的竞争力在于错位发展，只有错位发展，才能充分发挥自身的比较优势，实现与周边区域的优势互补和共同发展。”因此，建设航运与物流中心，依据自身优势错位发展为南沙新区未来发展方向，港口和口岸服务为建设重点。广州是内地的华南门户，香港是国际航运中心，两者之间应通过合作发展实现共赢。
《广州南沙新区发展规划》中指出将南沙打造成“粤港澳全面合作示范区”，使南沙建设的实践在泛珠三角合作中具有独特的价值。日前，广州市委书记任学锋在南沙调研时也提出“要求南沙要集聚发展创新发展，建设国际航运中心。”
广州南沙新区地理位置优越，发展空间广阔、生态环境良好、基础设施完善，具备在各个方面与港澳等地区全面合作的综合优势。南沙新区位于珠三角几何中心，周边建设、规划的“五纵五横”的路网便利地连通广州市区、东莞、深圳等地。从南沙坐船到港澳只需要40分钟，并且到珠海、中山这样的珠三角制造业城市只需要半小时航程。于此同时，包括广深港高铁、南沙客运港等一批重点项目已建成使用，为南沙提供了良好的通关便利化基础设施。此外，南沙还是广州的深水良港，可通往全国各地乃至欧美各国。
随着定位为“对接港澳，联通西江，服务泛珠三角”的综合航运服务平台的广州航运交易所落户南沙，南沙在产业规划方面重点发展航运物流业，打造相关产业集群。依托保税港区，南沙引进了一批港澳航运物流企业，推动建设新型电子商务港园区。近日，南沙港成为全国首批进境粮食指定口岸，而且汽车整车进口大通道也已正式打通。广州将以南沙港区为依托，规划建设21世纪海上丝绸之路经济合作区，鼓励本土企业走出去，并建设境外工业园，开拓境外投资市场，加强同国外企业合作。此外，南沙还将重点打造南中国顶级游艇会和国际邮轮码头等项目，推动滨海旅游业发展。
根据国家“十二五”规划的内容，广州南沙打造服务内地、连接港澳的商业服务中心、科技创新中心和教育培训基地，建设临港产业配套服务合作区。“粤港澳优质生活圈、新型城市化典范、以生产性服务业为主导的现代产业新高地、具有世界先进水平的综合服务枢纽和社会管理服务创新试验区”是《新区发展规划》赋予南沙的五个功能定位。与前海、横琴不同，南沙占地面积大，其经济建设模式对广东来说真正具有借鉴价值。
机遇总是与挑战并行。南沙在航运业方面与香港相比，并不具备绝对优势。香港作为国际航运中心，拥有完善的航空及其他交通网络可连接全球各地，而且背靠中国华南经济腹地，辐射内地旅游市场，地理优势得天独厚。香港中华总商会荣誉会长霍震寰曾指出“目前不少港商对于是否进驻南沙新区还处于观望，希望等待更多优惠政策出台。”港澳服务业发达，而目前南沙新区对于现代服务业的政策还不够明朗将限制南沙新区港澳业界人士的吸引力。除此之外，人才短缺也是将制约南沙新区未来的发展，南沙新区缺乏对高端人才的吸引力，而市场并不能完全解决人才流动问题。
国家发改委副秘书长范恒山曾指出“南沙新区的竞争力在于错位发展，只有错位发展，才能充分发挥自身的比较优势，实现与周边区域的优势互补和共同发展。”因此，建设航运与物流中心，依据自身优势错位发展为南沙新区未来发展方向，港口和口岸服务为建设重点。广州是内地的华南门户，香港是国际航运中心，两者之间应通过合作发展实现共赢。南沙新区未来的发展方向并非与香港竞争，而应进一步巩固香港航运中心的地位，进一步聚合和整合航运相关要素和资源，打造服务内地、连接港澳的产业配套服务合作区，着力打造区域性航运中心。南沙还应着力建设航运相关产业，如设立船舶金融租赁、航运保险等专业性金融机构等。除此之外，南沙新区还应改善人才引入机制，优化软环境，实现长效可持续发展。（
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